蛋白Marker可分為:一、未預(yù)染的Marker即寬分子
量蛋白標準、高分子量蛋白標準以及低分子量蛋白標準;二、預(yù)染的Marker即單色預(yù)染和多色預(yù)染。
在western blot
過程中,分子量Marker就像個螺絲釘一樣沒雖然是個小細節(jié),然而就是這樣一個小細節(jié)對實驗結(jié)果有著不可忽視的作用。這個 Western
Blot參照家族的一員的作用主要是用來指示蛋白條帶所對應(yīng)的分子量大小,只有標準量精確無誤了,實驗結(jié)果才有說服力,除此之外,蛋白標準還有表示轉(zhuǎn)移成功或者蛋白在凝膠上的電泳程度等等的作用,所以選擇正確的蛋白Marker也是western
blot實驗成功的必要條件之一。
總體來說,蛋白分子
量標準可以分成未染蛋白分子量標準、預(yù)染蛋白分子量標準二個級別。以下是關(guān)于蛋白分子量標準的小敘:
一. 未染色(pre mixed)蛋白分子 量標準
未染色的蛋白分子
量標準是簡單,也是準確的一種。由于沒有附帶染料分子或者是標記分子,所示大小正好是蛋白原本的大小,是精確判斷蛋白大小必須的。現(xiàn)在的Marker多數(shù)都選用預(yù)混和的Marker,方便不同大小的蛋白比較。預(yù)混的Marker通常有幾條帶加倍濃度作為指示,因為混合的條帶越多,越不好記,誰知道哪條是那條!數(shù)到眼都花了。所以當看到特別濃的那幾條標志帶就記得是哪里了。不過要記得,小帶通常都不那么容易看清楚的。在選擇上來說,當然是選擇其中至少有一條條帶和自己的目的蛋白大小相近的好,越近越好。如果你的蛋白不幸在兩條跨度較大Marker條帶之間,選別的Marker吧。預(yù)混的Marker使用上不如預(yù)染Marker(pre-stained)好用,因為電泳過程中完全看不到,要和目標蛋白一起等到后染色才“開蠱”,無法對實驗起預(yù)示參照作用。完全屬于“后知后覺”型的,當然還是比“不知不覺”不做對照的要好。
① 寬分子量蛋白標準
如果從實驗室總體考慮的,就選范圍盡量寬,條帶分布比較均勻的,這樣你的蛋白無論在哪個區(qū)間都容易判斷,避免正好落在一段空白區(qū)的危險。不過條帶越多,每次上樣量也就越費。拿到Marker后,如果買的是大包裝,就應(yīng)該考慮分裝。多次反復(fù)凍融對于蛋白的危險,不用多說吧。另外要記得,寬譜的 |