 如今的生物學(xué)研究已經(jīng)離不開生物信息學(xué)的輔佐,這里老談給大家介紹目前研究miRNA的一些在線數(shù)據(jù)庫(kù)，看看它們是如何幫助你們?cè)诿罎L打中找準(zhǔn)方向的。這些數(shù)據(jù)庫(kù)中既有“進(jìn)口”沖鋒槍miRbase，又不乏“國(guó)產(chǎn)”戰(zhàn)斗機(jī)starbase。每一個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)的功能又不盡相同，既有分子間相互作用的預(yù)測(cè)，又有對(duì)已報(bào)道實(shí)驗(yàn)結(jié)果的總結(jié)和整合。
1、starBase：
一個(gè)高通量實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)CLIP-Seq（或稱為HITS-CLIP,PAR-CLIP,iCLIP）和mRNA降解組測(cè)序數(shù)據(jù)支持的microRNA靶標(biāo)數(shù)據(jù)庫(kù),包含了miRNA-mRNA，miRNA-lncRNA，miRNA-circRNA，miRNA-ceRNA 和RNA-protein等的調(diào)控關(guān)系。整合和構(gòu)建多個(gè)流行的靶標(biāo)預(yù)測(cè)軟件的交集和調(diào)控關(guān)系。新版本發(fā)布時(shí)間：2013年11月。
網(wǎng)址：http://starbase.sysu.edu.cn/
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