一、GST
pull-down實驗
基本原理:將靶蛋白-GST融合蛋白親和固化在谷胱甘肽親和樹脂上,作為與目的蛋白親和的支撐物,充當一種“誘餌蛋白”,目的蛋白溶液過柱,可從中捕獲與之相互作用的“捕獲蛋白”(目的蛋白),洗脫結合物后通過SDS-PAGE電泳分析,從而證實兩種蛋白間的相互作用或篩選相應的目的蛋白,“誘餌蛋白”和“捕獲蛋白”均可通過細胞裂解物、純化的蛋白、表達系統以及體外轉錄翻譯系統等方法獲得。此方法簡單易行,操作方便。注：GST即谷胱甘肽巰基轉移酶(glutathione
S-transferase)
二、足印法（Footprinting）
足印法（Footprinting）是一種用來測定DNA-蛋白質專一性結合的方法，用于檢測目的DNA序列與特定蛋白質的結合，也可展示蛋白質因子同特定DNA片段之間的結合。其原理為：DNA和蛋白質結合后，DNA與蛋白的結合區域不能被DNase（脫氧核糖核酸酶）分解，在對目的DNA序列進行檢測時便出現了一段無DNA序列的空白區(即蛋白質結合區)，從而了解與蛋白質結合部位的核苷酸數目及其核苷酸序列。
三、染色質免疫共沉淀技術（Chromatin
Immunoprecipitation，ChIP）
染色質免疫共沉淀技術（Chromatin
Immunoprecipitation，ChIP）是研究體內蛋白質與DNA相互作用的有力工具，利用該技術不僅可以檢測體內反式因子與DNA的動態作用，還可以用來研究組蛋白的各種共價修飾以及轉錄因子與基因表達的關系。
染色質免疫沉淀技術的原理是：在生理狀態下把細胞內的DNA與蛋白質交聯在一起，通過超聲或酶處理將染色質切為小片段后，利用抗原抗體的特異性識別
反應，將與目的蛋白相結合的DNA片段沉淀下來。染色質免疫沉淀技術一般包括細胞固定，染色質斷裂，染色質免疫沉淀，交聯反應的逆轉，DNA的純化及鑒定。
四、基因芯片（又稱
DNA 芯片、生物芯片）技術
基因芯片指將大量探針分子固定于支持物上后與標記的樣品分子進行雜交，通過檢測每個探針分子的雜交信號強度進而獲取樣品分子的數量和序列信息。通俗地說，就是通過微加 |
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